启动子是指DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域，通常位于编码基因的上游。在启动子片段中存在大量的顺式作用原件，转录因子通过与顺式作用原件结合从而调控基因的转录使基因具有时空表达特异性。所以启动子的分离和功能分析是基因工程研究的重要内容。

植物基因工程中常用到的启动子按其作用方式和功能分为3类：组成型、组织特异型以及诱导型启动子。组织特异型启动子能使目的基因的表达产物在一定器官或组织部位积累，增加局部表达量。这样避免了基因过量表达对植物体造成的伤害，同时也可以避免植物营养的不必要浪费。所以近年组织特异型启动子的研究备受关注。近年来，随着现代基因工程技术的发展，获得了很多转基因植物包括很多粮食作物，但是食品安全问题却制约了转基因农作物的推广和发展。转基因水稻中外源基因在胚乳中表达致使外源蛋白在其中积累，是影响一些具有很好品质的转基因水稻发展受限制的主要因素。针对这种现象，利用组织特异型启动子使外源基因只在营养器官中表达而在人类食用部分不表达以降低食品安全风险是促进转基因水稻和转基因农作物推广的一个重要途径。

该发明公开了一种水稻组蛋白脱乙酰化酶基因HDT701启动子及其应用。本发明从水稻中克隆出HDT701基因的启动子：水稻组蛋白脱乙酰化酶基因HDT701启动子，该启动子能够启动下游基因在水稻中的部分器官中表达，是一个组织特异性启动子，因此可将其应用于转基因工程中，使的目的基因的表达产物在一定的器官或组织部位积累，增加局部表达量，同时也可以避免植物营养的不必要浪费，因此在转基因工程中有良好的应用前景。