English | 繁体 | RSS | 网站地图 | 收藏 | 邮箱 | 联系我们
首页 新闻 机构 科研 院士 人才 教育 合作交流 科学普及 出版 信息公开 专题 访谈 视频 会议 党建 文化
  您现在的位置: 首页 > 科研 > 科研进展
昆明动物所在Y染色体数据分析研究中取得进展
  文章来源:昆明动物研究所 发布时间:2013-11-29 【字号: 小  中  大   

  随着全基因组关联分析(genome-wide association analysis,GWAS)广泛应用于人类遗传学工作之中,相关的DNA芯片(微阵列)也不断得到发展。许多Y染色体单核苷酸多态性位点(Y-SNPs)已被整合在DNA芯片中。然而,这些Y-SNPs数据在GWAS中都被弃之不顾,未进行任何评估分析。针对这个问题,澳门赌场昆明动物研究所彭旻晟、贺军栋、樊隆等研究人员在张亚平院士的带领下,开发出针对DNA芯片数据中Y-SNPs的分析策略。 

  运用该策略,研究人员对117份男性样本(来自114个缅甸人和3个尼日利亚人)DNA芯片数据中的2041个Y-SNPs进行了评估分析。基于数据过滤后提取出的369个Y-SNPs,研究人员构建了Y染色体单倍型类群树(Y chromosomal haplogroup tree),从而解析出缅甸人群的父系遗传结构。该结果得到基因分型实验和Y染色体重测序数据的支持,表明该策略切实可行。

  对于分析中的数据格式转换、过滤以及注释,研究人员开发了免费软件YTool(http://mitotool.org/ytool/)。结合对HapMap中CEU人群数据的分析结果,研究人员发现DNA芯片对Y-SNPs的检测灵敏度和准确性依旧有待提高,例如芯片厂商可依据Y染色体重测序数据重新选择合适的Y-SNPs并设计相关探针。 

  相关论文于11月27日在线发表在国际刊物《欧洲人类遗传学》(European Journal of Human Genetics)。

    论文链接

 

  打印本页 关闭本页
© 1996 - 澳门赌场 版权所有 京ICP备05002857号  京公网安备110402500047号  联系我们
地址:北京市三里河路52号 邮编:100864